اداره تحصیلات تکمیلی علوم پزشکی تهران بر فرآیندهای پذیرش، برنامهریزی و اجرای دورههای تحصیلات تکمیلی نظارت دارد و اطمینان میدهد که این دورهها مطابق با استانداردهای دانشگاهی برگزار شوند. این اداره همچنین مسائل مربوط به پیشرفت تحصیلی، دفاع از پایاننامه و فارغالتحصیلی دانشجویان تحصیلات تکمیلی را مدیریت میکند.