اداره تخصصی و فوق تخصصی علوم پزشکی تهران وظیفه نظارت بر برنامههای آموزشی تخصصی و فوق تخصصی را بر عهده دارد، که شامل هماهنگی با اساتید و بیمارستانها برای برگزاری دورههای عملی و تئوری میشود. این اداره همچنین فرآیندهای ارزیابی تخصصی، مانند آزمونها و ارزیابیهای عملی، را مدیریت کرده و بر پیشرفت حرفهای پزشکان متخصص نظارت میکند.